食用菌病虫害的防治必须贯彻“预防为主，综合防治”的方针，其中特别强调栽培技术措施的作用，创造良好的有利于食用菌生长发育的生态环境条件，以预防病虫害的危害，可以得到事半功倍的功效。除采用生态防治方法外，还要综合使用生物防治方法、物理防治方法及化学农药防治方法。这里介绍食用菌栽培过程中必须做好的几方面工作。
    一、搞好菇房环境卫生。搞好环境卫生室有效防治食用菌病虫害的主要手段。做好菇场日常清洁卫生，讲废弃物和污染物及时烧毁或深埋，及时清理周边环境中的杂草、垃圾及各种有机残体，避免病虫害滋生，避免使用不洁的污水。可在周围撒上生石灰保持菇房干燥和防治咋就滋生。特别是上一年的废料，一定要及时清理干净。
   二、对老菇房进行粉刷和熏蒸消毒。老菇房使用前可以石灰水粉刷冲洗一遍，然后用烟雾克霉灵或甲醛与高锰酸钾进行熏蒸消毒杀菌。
   三、制作高质量的培养料。高质量的培养料是获得丰产高产的物流基础。首先选着的培养料要新鲜、干燥及无发霉变质现象；其次是培养料的碳氮比营养比例适宜；第三是含水量适中，掌握在65%左右；第四十堆制方法要合理；第五十培养料酸碱度要适宜，保证发酵或灭菌后的培养料呈若碱性。
   四、培养料灭菌。高压灭菌时要先排净冷气，（就是排气阀开始大量排出热气后在维持5-10分钟），如果冷气排不净，会形成假压，就是压力虽然达到了，但温度没有达到，而造成灭菌不彻底。常压灭菌加热时要攻头守尾保中间，也就是开始要大火猛烧，尽快（4小时内）达到100度，然后保持温度10-12个小时，最后2小时在大火猛烧，就可以了。一定要严格灭菌，如果灭菌不彻底造成批量污染，没有任何补救措施。
   五、选择使用优良菌种。栽培用的菌种，不论是瓶装还是袋装菌种，不论是谷粒菌种，还是棉壳菌种要求是，菌种纯正，生活力强，不带病虫害。菌种纯正是指栽培的品种必须是可靠的当家品种，作为规模性生产，一个菇房内适宜播种同一品种，便于管理。生活力强包括菌丝生长正常，菌龄适中，无老化，退化现象，这样的菌种播后，萌发快，封面早，有效抑制各种杂菌的发展，菌龄过老或在较高温度下存放时间过长，或培养料含水量过高，都直接影响菌种的活力，这样的菌种播种后萌发慢，迟迟不萌发，有利于各种病菌杂菌的生长，导致栽培失败。
   六、适时播种和适当加大接种量。目前人工栽培的食用菌，除草菇要求的高温季节播种外，其余的食用菌都需要避开高温播种。在25℃左右的适宜温度下播种虽然可以使食用菌加快发菌速度，但也往往有利于病害和杂菌生长。在较低温度下播种可以有效抑制杂菌的生长。为了让食用菌菌丝尽快长满料面抑制杂菌生长，适当增加菌种用量是最有效的方法。
   七、严格接种操作。要严格按照无菌操作程序进行接种。接种室要严格消毒，各种杀菌药物交替使用，以免杂菌产生抗药性，影响杀菌效果。接种人员进入接种室前要换工作服、戴工作帽、穿工作鞋，接种前做好菌种的预处理，双手要用75％的酒精消毒，接种工具除用75%的酒精消毒后还要在酒精火焰灼烧灭菌；接种室，菌种瓶用酒精灯火焰封口，动作要迅速，菌种量应适中，并要避免人员走动和交谈;接种后要及时打扫卫生、保持室内清洁。
  八、科学管理菇房。菇房应按照各种食用菌的生物学特性调节温湿度，注意通风换气，创造最适宜栽培的环境条件，提高栽培食用菌抵抗病菌侵入和杂菌污染的能力。菇房的位置应尽可能与养殖场保持一定的距离，防治虫螨转移到菇房危害。
  九、及时采收和清理老烂菇根，适时采收，即可保证食用菌的品种和产量，又可减少病虫害。开伞过久的子实体，由于孢子大量形成和释放，不但降低了子实体的品种和产量，也易受病菌侵染发生病害，而且工作人员长期在有大量孢子环境中工作会引起身体不适。、当一批食用菌采摘完后，及时清除菌根和枯死的小菇、病菇，对防治病害的发生和传播有很好的效果，对下一批菌蕾的形成也有好处。
  十、及时防治病虫螨害。要以预防为主，防治结合，一旦发生杂菌污染或病虫螨后，应及时采取有效措施防治。
  十一、定期换茬或轮作。长期使用同一栽培场所栽培食用菌，病害基数大，对于发生过严重病害的出菇棚或栽培场所应采取换茬或轮作的方法，定期轮换栽培场所，可以有效避免病虫害的再次爆发、